Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP27Q6ZUM4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms