Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPN12Q6ZSI9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN12Q6ZSI9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms