Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC73Q6ZRK6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms