Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFXL1Q6ZNB6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms