Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB5

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZNB5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6ZNB5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms