Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms