Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUSD1Q6UWL2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SUSD1Q6UWL2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms