Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C16orf54Q6UWD8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms