Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4L9Q6RFH8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4L9Q6RFH8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms