Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATAD2Q6PL18 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATAD2Q6PL18 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATAD2Q6PL18 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms