Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LETMD1Q6P1Q0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LETMD1Q6P1Q0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms