Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KANK3Q6NY19 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms