Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD54Q6NXT1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms