Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RWDD4Q6NW29 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RWDD4Q6NW29 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms