Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRNP1Q6NT89 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRNP1Q6NT89 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms