Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ANKRD40Q6AI12 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD40Q6AI12 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms