Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms