Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFL1Q5TGJ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms