Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms