Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN4Q5BKX8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN4Q5BKX8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms