Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC93Q567U6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms