Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RFTN2Q52LD8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms