Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC39A12Q504Y0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms