Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP24-1Q3LI83 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP24-1Q3LI83 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms