Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms