Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ME3Q16798 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME3Q16798 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ME3Q16798 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ME3Q16798 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ME3Q16798 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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