Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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