Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B3Q16720 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B3Q16720 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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