Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTRK3Q16288 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTRK3Q16288 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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