Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF1CQ15572 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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