Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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SEC23BQ15437 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC23BQ15437 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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