Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUM3Q15397 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
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