Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB35Q15286 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms