Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HERC3Q15034 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERC3Q15034 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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