Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SQLEQ14534 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SQLEQ14534 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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