Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA1CQ13936 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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