Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTCH1Q13635 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTCH1Q13635 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTCH1Q13635 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTCH1Q13635 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTCH1Q13635 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTCH1Q13635 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTCH1Q13635 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTCH1Q13635 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTCH1Q13635 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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