Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4BQ13620 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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