Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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