Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms