Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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