Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNTB2Q13425 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNTB2Q13425 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms