Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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IFT88Q13099 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFT88Q13099 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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