Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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