Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB40BQ12829 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms