Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms