Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4BQ07343 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms