Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EGR3Q06889 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EGR3Q06889 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms