Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms