Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms